正常來說扁桃腺不太會形成結石，因為健康的扁桃腺可以排除細菌不易造成累積，而不健康的扁桃腺排除細菌異物的效率差，容易導致扁桃腺發炎，更間接使小隱窩加深，使得細菌、殘渣更容易久積而形成結石。姑且以道路形容扁桃腺，車流量形容外來異物，一個健康的扁桃腺就如一條筆直無障礙的三線道，即使再大的車流量也能暢行無阻的經過不阻塞，相對的，一個不健康的扁桃腺如一條曲折充滿障礙的單行道，容易因一些車流導致大塞車，而這些阻塞物滯留於小隱溝又會導致扁桃腺運作效率下降如此的惡性循環，扁桃腺每況愈下，容易造成喉嚨不時感覺卡卡的，不只影響身體健康，生活品質也會因此受到干擾。

而不整潔的口腔也會造成結石，牙齒是人類咀嚼食物的利器，我們將食物以牙齒磨碎再吞嚥，因此常有食物的小碎渣卡在口腔之中，如果沒有做好整潔的工作，口腔很容易會成為細菌的溫床，而大量的細菌給了扁桃腺大量的工作量，造成大量的負擔，若扁桃腺無暇應付而細菌長期累積，久之，扁桃腺就會發炎。

雖然如此，經過以上的研究論證，在沒有迫切的需求下也不要任意進行切除術，就算是在醫療上的需要，也需審慎地評估，因為在兒童時期扁桃腺的免疫機能相當活潑有益，其體積也相對地較成人為大，因此兒童割除了扁桃腺相當於身體失去了重要的防禦，建議向正常醫療管道詢問必要性再進行手術。